Protein–RNA interactions for Protein: Q8N386

LRRC25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25Q8N386 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC25Q8N386 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC25Q8N386 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC25Q8N386 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC25Q8N386 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC25Q8N386 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC25Q8N386 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC25Q8N386 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC25Q8N386 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC25Q8N386 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC25Q8N386 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms