Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
KLHL34Q8N239 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KLHL34Q8N239 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
KLHL34Q8N239 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KLHL34Q8N239 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KLHL34Q8N239 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KLHL34Q8N239 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KLHL34Q8N239 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KLHL34Q8N239 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KLHL34Q8N239 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
KLHL34Q8N239 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KLHL34Q8N239 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KLHL34Q8N239 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KLHL34Q8N239 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KLHL34Q8N239 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KLHL34Q8N239 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KLHL34Q8N239 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KLHL34Q8N239 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KLHL34Q8N239 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KLHL34Q8N239 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KLHL34Q8N239 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KLHL34Q8N239 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KLHL34Q8N239 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KLHL34Q8N239 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
KLHL34Q8N239 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KLHL34Q8N239 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KLHL34Q8N239 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KLHL34Q8N239 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KLHL34Q8N239 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KLHL34Q8N239 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
KLHL34Q8N239 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KLHL34Q8N239 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KLHL34Q8N239 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KLHL34Q8N239 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KLHL34Q8N239 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KLHL34Q8N239 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KLHL34Q8N239 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KLHL34Q8N239 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KLHL34Q8N239 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KLHL34Q8N239 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KLHL34Q8N239 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KLHL34Q8N239 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KLHL34Q8N239 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KLHL34Q8N239 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KLHL34Q8N239 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms