Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYCP3Q8IZU3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP3Q8IZU3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP3Q8IZU3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYCP3Q8IZU3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP3Q8IZU3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP3Q8IZU3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP3Q8IZU3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP3Q8IZU3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYCP3Q8IZU3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP3Q8IZU3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP3Q8IZU3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYCP3Q8IZU3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SYCP3Q8IZU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP3Q8IZU3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms