Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP9Q8IXQ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP9Q8IXQ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP9Q8IXQ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP9Q8IXQ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP9Q8IXQ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP9Q8IXQ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP9Q8IXQ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP9Q8IXQ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP9Q8IXQ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP9Q8IXQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP9Q8IXQ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP9Q8IXQ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP9Q8IXQ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms