Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWU2

LMTK2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK2Q8IWU2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
LMTK2Q8IWU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
LMTK2Q8IWU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
LMTK2Q8IWU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
LMTK2Q8IWU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LMTK2Q8IWU2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LMTK2Q8IWU2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
LMTK2Q8IWU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LMTK2Q8IWU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
LMTK2Q8IWU2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LMTK2Q8IWU2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
LMTK2Q8IWU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
LMTK2Q8IWU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
LMTK2Q8IWU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
LMTK2Q8IWU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
LMTK2Q8IWU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LMTK2Q8IWU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.28■■■■■ 4.04
LMTK2Q8IWU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.26■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
LMTK2Q8IWU2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
LMTK2Q8IWU2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
LMTK2Q8IWU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
LMTK2Q8IWU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
LMTK2Q8IWU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
LMTK2Q8IWU2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
LMTK2Q8IWU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
LMTK2Q8IWU2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
LMTK2Q8IWU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
LMTK2Q8IWU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
LMTK2Q8IWU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
LMTK2Q8IWU2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
LMTK2Q8IWU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
LMTK2Q8IWU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
LMTK2Q8IWU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
LMTK2Q8IWU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
LMTK2Q8IWU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
LMTK2Q8IWU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
LMTK2Q8IWU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
LMTK2Q8IWU2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
LMTK2Q8IWU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
LMTK2Q8IWU2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
LMTK2Q8IWU2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
LMTK2Q8IWU2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
LMTK2Q8IWU2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
LMTK2Q8IWU2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
LMTK2Q8IWU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
LMTK2Q8IWU2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
LMTK2Q8IWU2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
LMTK2Q8IWU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms