Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL0

NAV3, Neuron navigator 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV3Q8IVL0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NAV3Q8IVL0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAV3Q8IVL0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAV3Q8IVL0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAV3Q8IVL0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAV3Q8IVL0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAV3Q8IVL0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NAV3Q8IVL0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NAV3Q8IVL0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAV3Q8IVL0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAV3Q8IVL0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAV3Q8IVL0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAV3Q8IVL0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAV3Q8IVL0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAV3Q8IVL0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAV3Q8IVL0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAV3Q8IVL0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAV3Q8IVL0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAV3Q8IVL0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAV3Q8IVL0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAV3Q8IVL0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAV3Q8IVL0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms