Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29P2Q8IUI4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX29P2Q8IUI4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29P2Q8IUI4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29P2Q8IUI4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29P2Q8IUI4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX29P2Q8IUI4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29P2Q8IUI4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29P2Q8IUI4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29P2Q8IUI4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX29P2Q8IUI4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX29P2Q8IUI4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29P2Q8IUI4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms