Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW0

SESTD1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESTD1Q86VW0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SESTD1Q86VW0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SESTD1Q86VW0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SESTD1Q86VW0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SESTD1Q86VW0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SESTD1Q86VW0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SESTD1Q86VW0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SESTD1Q86VW0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SESTD1Q86VW0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SESTD1Q86VW0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SESTD1Q86VW0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SESTD1Q86VW0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SESTD1Q86VW0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SESTD1Q86VW0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SESTD1Q86VW0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SESTD1Q86VW0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SESTD1Q86VW0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SESTD1Q86VW0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SESTD1Q86VW0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms