Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCA5Q86VQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCA5Q86VQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCA5Q86VQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCA5Q86VQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCA5Q86VQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCA5Q86VQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCA5Q86VQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCA5Q86VQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCA5Q86VQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCA5Q86VQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCA5Q86VQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCA5Q86VQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms