Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PACS2Q86VP3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PACS2Q86VP3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PACS2Q86VP3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PACS2Q86VP3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PACS2Q86VP3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PACS2Q86VP3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PACS2Q86VP3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PACS2Q86VP3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACS2Q86VP3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PACS2Q86VP3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PACS2Q86VP3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PACS2Q86VP3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PACS2Q86VP3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PACS2Q86VP3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PACS2Q86VP3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACS2Q86VP3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PACS2Q86VP3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PACS2Q86VP3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms