Protein–RNA interactions for Protein: Q86UL3

GPAT4, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT4Q86UL3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT4Q86UL3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT4Q86UL3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT4Q86UL3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAT4Q86UL3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms