Protein–RNA interactions for Protein: Q86UL3

GPAT4, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT4Q86UL3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT4Q86UL3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAT4Q86UL3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAT4Q86UL3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT4Q86UL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT4Q86UL3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAT4Q86UL3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT4Q86UL3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT4Q86UL3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT4Q86UL3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT4Q86UL3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAT4Q86UL3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms