Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PKD1L3Q7Z443 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PKD1L3Q7Z443 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PKD1L3Q7Z443 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PKD1L3Q7Z443 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PKD1L3Q7Z443 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PKD1L3Q7Z443 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PKD1L3Q7Z443 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PKD1L3Q7Z443 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PKD1L3Q7Z443 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PKD1L3Q7Z443 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PKD1L3Q7Z443 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PKD1L3Q7Z443 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PKD1L3Q7Z443 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PKD1L3Q7Z443 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PKD1L3Q7Z443 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PKD1L3Q7Z443 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PKD1L3Q7Z443 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PKD1L3Q7Z443 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PKD1L3Q7Z443 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PKD1L3Q7Z443 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PKD1L3Q7Z443 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PKD1L3Q7Z443 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PKD1L3Q7Z443 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PKD1L3Q7Z443 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PKD1L3Q7Z443 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PKD1L3Q7Z443 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PKD1L3Q7Z443 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PKD1L3Q7Z443 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PKD1L3Q7Z443 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PKD1L3Q7Z443 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PKD1L3Q7Z443 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PKD1L3Q7Z443 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PKD1L3Q7Z443 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PKD1L3Q7Z443 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PKD1L3Q7Z443 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PKD1L3Q7Z443 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms