Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2G1

H2BFWT, Histone H2B type W-T, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFWTQ7Z2G1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2BFWTQ7Z2G1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2BFWTQ7Z2G1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2BFWTQ7Z2G1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2BFWTQ7Z2G1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2BFWTQ7Z2G1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2BFWTQ7Z2G1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2BFWTQ7Z2G1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2BFWTQ7Z2G1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H2BFWTQ7Z2G1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2BFWTQ7Z2G1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2BFWTQ7Z2G1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2BFWTQ7Z2G1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2BFWTQ7Z2G1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2BFWTQ7Z2G1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms