Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHFQ7M4L6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHFQ7M4L6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHFQ7M4L6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHFQ7M4L6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHFQ7M4L6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHFQ7M4L6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHFQ7M4L6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHFQ7M4L6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHFQ7M4L6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHFQ7M4L6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHFQ7M4L6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHFQ7M4L6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHFQ7M4L6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHFQ7M4L6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHFQ7M4L6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHFQ7M4L6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms