Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PREX2Q70Z35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PREX2Q70Z35 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PREX2Q70Z35 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
PREX2Q70Z35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.16■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
PREX2Q70Z35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PREX2Q70Z35 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
PREX2Q70Z35 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PREX2Q70Z35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
PREX2Q70Z35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PREX2Q70Z35 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
PREX2Q70Z35 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PREX2Q70Z35 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
PREX2Q70Z35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PREX2Q70Z35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PREX2Q70Z35 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PREX2Q70Z35 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PREX2Q70Z35 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PREX2Q70Z35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PREX2Q70Z35 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PREX2Q70Z35 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PREX2Q70Z35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
PREX2Q70Z35 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PREX2Q70Z35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PREX2Q70Z35 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PREX2Q70Z35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PREX2Q70Z35 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PREX2Q70Z35 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
PREX2Q70Z35 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PREX2Q70Z35 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PREX2Q70Z35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PREX2Q70Z35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PREX2Q70Z35 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
PREX2Q70Z35 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PREX2Q70Z35 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
PREX2Q70Z35 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PREX2Q70Z35 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PREX2Q70Z35 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
PREX2Q70Z35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
PREX2Q70Z35 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PREX2Q70Z35 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
PREX2Q70Z35 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PREX2Q70Z35 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PREX2Q70Z35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
PREX2Q70Z35 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
PREX2Q70Z35 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PREX2Q70Z35 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PREX2Q70Z35 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PREX2Q70Z35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PREX2Q70Z35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PREX2Q70Z35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PREX2Q70Z35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PREX2Q70Z35 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms