Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCBE1Q6UXH8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCBE1Q6UXH8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCBE1Q6UXH8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCBE1Q6UXH8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCBE1Q6UXH8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCBE1Q6UXH8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCBE1Q6UXH8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms