Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LARP1Q6PKG0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LARP1Q6PKG0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LARP1Q6PKG0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LARP1Q6PKG0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LARP1Q6PKG0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LARP1Q6PKG0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LARP1Q6PKG0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LARP1Q6PKG0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LARP1Q6PKG0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LARP1Q6PKG0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LARP1Q6PKG0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
LARP1Q6PKG0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LARP1Q6PKG0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
LARP1Q6PKG0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LARP1Q6PKG0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
LARP1Q6PKG0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LARP1Q6PKG0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LARP1Q6PKG0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LARP1Q6PKG0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
LARP1Q6PKG0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
LARP1Q6PKG0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
LARP1Q6PKG0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LARP1Q6PKG0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LARP1Q6PKG0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LARP1Q6PKG0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LARP1Q6PKG0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LARP1Q6PKG0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LARP1Q6PKG0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LARP1Q6PKG0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LARP1Q6PKG0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LARP1Q6PKG0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LARP1Q6PKG0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LARP1Q6PKG0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LARP1Q6PKG0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LARP1Q6PKG0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LARP1Q6PKG0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LARP1Q6PKG0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LARP1Q6PKG0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LARP1Q6PKG0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LARP1Q6PKG0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LARP1Q6PKG0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LARP1Q6PKG0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
LARP1Q6PKG0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
LARP1Q6PKG0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LARP1Q6PKG0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LARP1Q6PKG0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LARP1Q6PKG0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LARP1Q6PKG0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LARP1Q6PKG0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LARP1Q6PKG0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LARP1Q6PKG0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
LARP1Q6PKG0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
LARP1Q6PKG0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms