Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF544Q6NX49 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF544Q6NX49 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF544Q6NX49 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF544Q6NX49 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF544Q6NX49 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF544Q6NX49 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF544Q6NX49 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF544Q6NX49 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF544Q6NX49 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF544Q6NX49 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF544Q6NX49 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF544Q6NX49 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF544Q6NX49 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF544Q6NX49 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF544Q6NX49 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF544Q6NX49 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF544Q6NX49 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF544Q6NX49 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms