Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRPF40BQ6NWY9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRPF40BQ6NWY9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRPF40BQ6NWY9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRPF40BQ6NWY9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PRPF40BQ6NWY9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRPF40BQ6NWY9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRPF40BQ6NWY9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRPF40BQ6NWY9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRPF40BQ6NWY9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRPF40BQ6NWY9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRPF40BQ6NWY9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRPF40BQ6NWY9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRPF40BQ6NWY9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRPF40BQ6NWY9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRPF40BQ6NWY9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRPF40BQ6NWY9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRPF40BQ6NWY9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRPF40BQ6NWY9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRPF40BQ6NWY9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRPF40BQ6NWY9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRPF40BQ6NWY9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRPF40BQ6NWY9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRPF40BQ6NWY9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRPF40BQ6NWY9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PRPF40BQ6NWY9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRPF40BQ6NWY9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRPF40BQ6NWY9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
PRPF40BQ6NWY9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRPF40BQ6NWY9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRPF40BQ6NWY9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRPF40BQ6NWY9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRPF40BQ6NWY9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms