Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms