Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZP7

LIN54, Protein lin-54 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN54Q6MZP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN54Q6MZP7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN54Q6MZP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN54Q6MZP7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN54Q6MZP7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN54Q6MZP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN54Q6MZP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN54Q6MZP7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms