Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTRHD1Q6GMV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTRHD1Q6GMV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTRHD1Q6GMV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTRHD1Q6GMV3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTRHD1Q6GMV3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTRHD1Q6GMV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTRHD1Q6GMV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTRHD1Q6GMV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms