Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6AWC8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6AWC8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6AWC8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6AWC8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6AWC8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6AWC8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6AWC8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6AWC8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6AWC8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6AWC8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6AWC8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6AWC8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6AWC8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6AWC8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6AWC8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6AWC8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6AWC8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6AWC8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6AWC8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6AWC8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6AWC8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6AWC8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6AWC8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6AWC8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6AWC8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6AWC8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6AWC8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6AWC8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6AWC8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6AWC8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6AWC8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6AWC8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6AWC8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6AWC8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6AWC8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6AWC8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6AWC8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6AWC8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6AWC8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6AWC8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6AWC8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6AWC8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6AWC8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6AWC8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6AWC8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6AWC8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6AWC8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6AWC8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6AWC8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6AWC8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6AWC8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6AWC8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6AWC8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6AWC8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6AWC8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6AWC8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6AWC8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6AWC8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6AWC8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6AWC8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6AWC8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6AWC8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6AWC8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6AWC8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6AWC8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6AWC8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6AWC8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6AWC8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6AWC8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6AWC8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6AWC8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6AWC8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6AWC8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6AWC8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6AWC8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6AWC8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6AWC8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6AWC8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6AWC8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6AWC8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6AWC8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6AWC8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6AWC8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6AWC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6AWC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6AWC8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6AWC8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6AWC8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6AWC8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6AWC8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6AWC8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6AWC8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6AWC8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6AWC8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6AWC8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6AWC8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q6AWC8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6AWC8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6AWC8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms