Protein–RNA interactions for Protein: Q5W188

CST9LP1, Putative cystatin-9-like protein CST9LP1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9LP1Q5W188 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CST9LP1Q5W188 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CST9LP1Q5W188 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST9LP1Q5W188 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CST9LP1Q5W188 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CST9LP1Q5W188 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST9LP1Q5W188 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CST9LP1Q5W188 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms