Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GFI1BQ5VTD9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GFI1BQ5VTD9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GFI1BQ5VTD9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GFI1BQ5VTD9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GFI1BQ5VTD9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GFI1BQ5VTD9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms