Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIF1Q5UIP0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIF1Q5UIP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIF1Q5UIP0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIF1Q5UIP0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIF1Q5UIP0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIF1Q5UIP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIF1Q5UIP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RIF1Q5UIP0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RIF1Q5UIP0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIF1Q5UIP0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIF1Q5UIP0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIF1Q5UIP0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIF1Q5UIP0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIF1Q5UIP0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIF1Q5UIP0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIF1Q5UIP0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RIF1Q5UIP0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIF1Q5UIP0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIF1Q5UIP0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIF1Q5UIP0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIF1Q5UIP0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RIF1Q5UIP0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIF1Q5UIP0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIF1Q5UIP0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIF1Q5UIP0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIF1Q5UIP0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIF1Q5UIP0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIF1Q5UIP0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIF1Q5UIP0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIF1Q5UIP0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIF1Q5UIP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIF1Q5UIP0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIF1Q5UIP0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms