Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HES3Q5TGS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HES3Q5TGS1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HES3Q5TGS1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HES3Q5TGS1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HES3Q5TGS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HES3Q5TGS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HES3Q5TGS1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HES3Q5TGS1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HES3Q5TGS1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HES3Q5TGS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HES3Q5TGS1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HES3Q5TGS1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HES3Q5TGS1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HES3Q5TGS1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HES3Q5TGS1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HES3Q5TGS1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HES3Q5TGS1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HES3Q5TGS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HES3Q5TGS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HES3Q5TGS1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HES3Q5TGS1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms