Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAX1Q5SQQ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAX1Q5SQQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
VAX1Q5SQQ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAX1Q5SQQ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAX1Q5SQQ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAX1Q5SQQ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAX1Q5SQQ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAX1Q5SQQ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAX1Q5SQQ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAX1Q5SQQ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAX1Q5SQQ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAX1Q5SQQ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAX1Q5SQQ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAX1Q5SQQ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAX1Q5SQQ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms