Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FFAR4Q5NUL3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FFAR4Q5NUL3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FFAR4Q5NUL3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FFAR4Q5NUL3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR4Q5NUL3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FFAR4Q5NUL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FFAR4Q5NUL3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FFAR4Q5NUL3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FFAR4Q5NUL3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FFAR4Q5NUL3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FFAR4Q5NUL3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FFAR4Q5NUL3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FFAR4Q5NUL3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms