Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC92Q53HC0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC92Q53HC0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC92Q53HC0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC92Q53HC0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC92Q53HC0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC92Q53HC0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC92Q53HC0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC92Q53HC0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC92Q53HC0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC92Q53HC0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC92Q53HC0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC92Q53HC0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC92Q53HC0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC92Q53HC0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms