Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BSXQ3C1V8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BSXQ3C1V8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BSXQ3C1V8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BSXQ3C1V8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BSXQ3C1V8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BSXQ3C1V8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BSXQ3C1V8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BSXQ3C1V8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BSXQ3C1V8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BSXQ3C1V8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BSXQ3C1V8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms