Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX4Q33E94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX4Q33E94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX4Q33E94 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX4Q33E94 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX4Q33E94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX4Q33E94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX4Q33E94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX4Q33E94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX4Q33E94 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms