Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DRB5Q30154 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DRB5Q30154 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DRB5Q30154 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DRB5Q30154 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DRB5Q30154 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DRB5Q30154 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DRB5Q30154 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DRB5Q30154 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DRB5Q30154 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DRB5Q30154 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRB5Q30154 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DRB5Q30154 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DRB5Q30154 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms