Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPEL1Q2QD12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPEL1Q2QD12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPEL1Q2QD12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPEL1Q2QD12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPEL1Q2QD12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPEL1Q2QD12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms