Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF4Q2M2E3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF4Q2M2E3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODF4Q2M2E3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF4Q2M2E3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF4Q2M2E3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODF4Q2M2E3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms