Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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