Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAPC1Q16533 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAPC1Q16533 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAPC1Q16533 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAPC1Q16533 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAPC1Q16533 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAPC1Q16533 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNAPC1Q16533 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAPC1Q16533 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAPC1Q16533 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAPC1Q16533 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAPC1Q16533 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAPC1Q16533 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAPC1Q16533 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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