Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC85BQ15834 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85BQ15834 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85BQ15834 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC85BQ15834 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC85BQ15834 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC85BQ15834 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC85BQ15834 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC85BQ15834 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC85BQ15834 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85BQ15834 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85BQ15834 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85BQ15834 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC85BQ15834 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC85BQ15834 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC85BQ15834 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC85BQ15834 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85BQ15834 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85BQ15834 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85BQ15834 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85BQ15834 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85BQ15834 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC85BQ15834 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC85BQ15834 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85BQ15834 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC85BQ15834 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85BQ15834 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC85BQ15834 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85BQ15834 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85BQ15834 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85BQ15834 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85BQ15834 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85BQ15834 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85BQ15834 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85BQ15834 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85BQ15834 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85BQ15834 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85BQ15834 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms