Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIP11Q15643 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIP11Q15643 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIP11Q15643 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIP11Q15643 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIP11Q15643 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIP11Q15643 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIP11Q15643 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIP11Q15643 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIP11Q15643 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIP11Q15643 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIP11Q15643 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIP11Q15643 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIP11Q15643 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP11Q15643 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIP11Q15643 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIP11Q15643 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIP11Q15643 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIP11Q15643 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIP11Q15643 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIP11Q15643 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms