Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A3R2Q15599 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R2Q15599 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A3R2Q15599 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3R2Q15599 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A3R2Q15599 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A3R2Q15599 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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