Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETDB1Q15047 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETDB1Q15047 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETDB1Q15047 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETDB1Q15047 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETDB1Q15047 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETDB1Q15047 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETDB1Q15047 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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SETDB1Q15047 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETDB1Q15047 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETDB1Q15047 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SETDB1Q15047 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SETDB1Q15047 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETDB1Q15047 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETDB1Q15047 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
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SETDB1Q15047 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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SETDB1Q15047 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SETDB1Q15047 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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SETDB1Q15047 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETDB1Q15047 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETDB1Q15047 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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SETDB1Q15047 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETDB1Q15047 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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SETDB1Q15047 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETDB1Q15047 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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SETDB1Q15047 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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SETDB1Q15047 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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SETDB1Q15047 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETDB1Q15047 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETDB1Q15047 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETDB1Q15047 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SETDB1Q15047 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
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SETDB1Q15047 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
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SETDB1Q15047 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETDB1Q15047 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETDB1Q15047 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETDB1Q15047 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETDB1Q15047 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETDB1Q15047 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETDB1Q15047 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETDB1Q15047 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
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