Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAPTM4AQ15012 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAPTM4AQ15012 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAPTM4AQ15012 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAPTM4AQ15012 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAPTM4AQ15012 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAPTM4AQ15012 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAPTM4AQ15012 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAPTM4AQ15012 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAPTM4AQ15012 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAPTM4AQ15012 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAPTM4AQ15012 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAPTM4AQ15012 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAPTM4AQ15012 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAPTM4AQ15012 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAPTM4AQ15012 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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