Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GPNMBQ14956 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPNMBQ14956 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPNMBQ14956 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPNMBQ14956 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPNMBQ14956 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GPNMBQ14956 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPNMBQ14956 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPNMBQ14956 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPNMBQ14956 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPNMBQ14956 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPNMBQ14956 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPNMBQ14956 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPNMBQ14956 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPNMBQ14956 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPNMBQ14956 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPNMBQ14956 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPNMBQ14956 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPNMBQ14956 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GPNMBQ14956 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPNMBQ14956 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPNMBQ14956 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPNMBQ14956 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPNMBQ14956 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPNMBQ14956 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPNMBQ14956 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GPNMBQ14956 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPNMBQ14956 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPNMBQ14956 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
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