Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms