Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGA7Q13683 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGA7Q13683 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA7Q13683 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ITGA7Q13683 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGA7Q13683 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGA7Q13683 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
ITGA7Q13683 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGA7Q13683 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGA7Q13683 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGA7Q13683 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGA7Q13683 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGA7Q13683 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGA7Q13683 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGA7Q13683 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGA7Q13683 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGA7Q13683 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGA7Q13683 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGA7Q13683 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGA7Q13683 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGA7Q13683 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGA7Q13683 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGA7Q13683 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGA7Q13683 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGA7Q13683 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGA7Q13683 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
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