Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTR4Q13639 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HTR4Q13639 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTR4Q13639 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTR4Q13639 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HTR4Q13639 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTR4Q13639 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTR4Q13639 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTR4Q13639 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HTR4Q13639 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HTR4Q13639 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HTR4Q13639 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTR4Q13639 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTR4Q13639 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTR4Q13639 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTR4Q13639 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTR4Q13639 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTR4Q13639 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HTR4Q13639 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTR4Q13639 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTR4Q13639 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HTR4Q13639 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HTR4Q13639 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTR4Q13639 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTR4Q13639 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTR4Q13639 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTR4Q13639 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
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