Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PWP1Q13610 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PWP1Q13610 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PWP1Q13610 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PWP1Q13610 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PWP1Q13610 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PWP1Q13610 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PWP1Q13610 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PWP1Q13610 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PWP1Q13610 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PWP1Q13610 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PWP1Q13610 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PWP1Q13610 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PWP1Q13610 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PWP1Q13610 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms