Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MADCAM1Q13477 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MADCAM1Q13477 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MADCAM1Q13477 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MADCAM1Q13477 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MADCAM1Q13477 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MADCAM1Q13477 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MADCAM1Q13477 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MADCAM1Q13477 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MADCAM1Q13477 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MADCAM1Q13477 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MADCAM1Q13477 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MADCAM1Q13477 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MADCAM1Q13477 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MADCAM1Q13477 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MADCAM1Q13477 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MADCAM1Q13477 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MADCAM1Q13477 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MADCAM1Q13477 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MADCAM1Q13477 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MADCAM1Q13477 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MADCAM1Q13477 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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