Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3AQ13472 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3AQ13472 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3AQ13472 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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