Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P3Q13401 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS2P3Q13401 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P3Q13401 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P3Q13401 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PMS2P3Q13401 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS2P3Q13401 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P3Q13401 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P3Q13401 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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